Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH2

FUNDC2, FUN14 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC2Q9BWH2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FUNDC2Q9BWH2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms