Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.7 ms