Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CABS1Q96KC9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CABS1Q96KC9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms