Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC50Q8IVM0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms