Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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