Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms