Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD47Q08722 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD47Q08722 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD47Q08722 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD47Q08722 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD47Q08722 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD47Q08722 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD47Q08722 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms