Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREMQ03060 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREMQ03060 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREMQ03060 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREMQ03060 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREMQ03060 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREMQ03060 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREMQ03060 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREMQ03060 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREMQ03060 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREMQ03060 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREMQ03060 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREMQ03060 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREMQ03060 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREMQ03060 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREMQ03060 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREMQ03060 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREMQ03060 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREMQ03060 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREMQ03060 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREMQ03060 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREMQ03060 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREMQ03060 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREMQ03060 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREMQ03060 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREMQ03060 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREMQ03060 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREMQ03060 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREMQ03060 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREMQ03060 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CREMQ03060 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREMQ03060 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREMQ03060 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREMQ03060 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREMQ03060 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREMQ03060 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREMQ03060 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREMQ03060 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREMQ03060 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREMQ03060 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms