Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms