Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCR1P46094 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCR1P46094 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCR1P46094 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCR1P46094 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCR1P46094 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCR1P46094 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCR1P46094 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCR1P46094 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCR1P46094 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCR1P46094 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCR1P46094 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCR1P46094 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCR1P46094 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCR1P46094 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCR1P46094 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCR1P46094 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms