Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms