Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAAF3Q8N9W5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms