Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN8P19075 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSPAN8P19075 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms