Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms