Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms