Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms