Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM8A1Q9UBU6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms