Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms