Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH6

RAB40A, Ras-related protein Rab-40A, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40AQ8WXH6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40AQ8WXH6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms