Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SGCAQ16586 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SGCAQ16586 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SGCAQ16586 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SGCAQ16586 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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