Protein–RNA interactions for Protein: Q00005

PPP2R2B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2BQ00005 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP2R2BQ00005 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms