Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4AP27815 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms