Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms