Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms