Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms