Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms