Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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RNF185Q96GF1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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RNF185Q96GF1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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RNF185Q96GF1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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RNF185Q96GF1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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