Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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