Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NUP107P57740 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NUP107P57740 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NUP107P57740 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP107P57740 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP107P57740 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP107P57740 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms