Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB1P16220 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB1P16220 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms