Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms