Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDM4BO94953 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDM4BO94953 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDM4BO94953 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDM4BO94953 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDM4BO94953 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDM4BO94953 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDM4BO94953 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDM4BO94953 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDM4BO94953 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDM4BO94953 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDM4BO94953 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KDM4BO94953 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KDM4BO94953 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KDM4BO94953 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KDM4BO94953 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KDM4BO94953 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KDM4BO94953 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KDM4BO94953 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KDM4BO94953 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
KDM4BO94953 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KDM4BO94953 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDM4BO94953 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDM4BO94953 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms