Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLOCKO15516 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms