Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms