Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms