Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms