Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms