Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PDCD1Q15116 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PDCD1Q15116 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PDCD1Q15116 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PDCD1Q15116 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PDCD1Q15116 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PDCD1Q15116 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PDCD1Q15116 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PDCD1Q15116 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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