Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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