Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TOP3AQ13472 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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TOP3AQ13472 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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TOP3AQ13472 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TOP3AQ13472 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TOP3AQ13472 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TOP3AQ13472 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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TOP3AQ13472 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TOP3AQ13472 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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