Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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