Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms