Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VSX2P58304 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VSX2P58304 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSX2P58304 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSX2P58304 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSX2P58304 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSX2P58304 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSX2P58304 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSX2P58304 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSX2P58304 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSX2P58304 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSX2P58304 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSX2P58304 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSX2P58304 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSX2P58304 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms