Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AQP4P55087 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AQP4P55087 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AQP4P55087 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AQP4P55087 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AQP4P55087 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AQP4P55087 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AQP4P55087 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AQP4P55087 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AQP4P55087 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AQP4P55087 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AQP4P55087 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AQP4P55087 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AQP4P55087 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AQP4P55087 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AQP4P55087 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AQP4P55087 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AQP4P55087 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AQP4P55087 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AQP4P55087 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AQP4P55087 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AQP4P55087 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AQP4P55087 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AQP4P55087 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AQP4P55087 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AQP4P55087 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AQP4P55087 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AQP4P55087 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AQP4P55087 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AQP4P55087 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AQP4P55087 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AQP4P55087 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AQP4P55087 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AQP4P55087 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AQP4P55087 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AQP4P55087 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AQP4P55087 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AQP4P55087 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AQP4P55087 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AQP4P55087 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AQP4P55087 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AQP4P55087 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AQP4P55087 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AQP4P55087 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AQP4P55087 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AQP4P55087 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AQP4P55087 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AQP4P55087 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AQP4P55087 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AQP4P55087 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AQP4P55087 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AQP4P55087 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AQP4P55087 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AQP4P55087 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AQP4P55087 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AQP4P55087 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AQP4P55087 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AQP4P55087 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AQP4P55087 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AQP4P55087 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AQP4P55087 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AQP4P55087 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AQP4P55087 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AQP4P55087 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AQP4P55087 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AQP4P55087 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AQP4P55087 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AQP4P55087 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AQP4P55087 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AQP4P55087 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AQP4P55087 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AQP4P55087 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AQP4P55087 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AQP4P55087 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AQP4P55087 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms