Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATE1O95260 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATE1O95260 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATE1O95260 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATE1O95260 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATE1O95260 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATE1O95260 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATE1O95260 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATE1O95260 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATE1O95260 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATE1O95260 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATE1O95260 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATE1O95260 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATE1O95260 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ATE1O95260 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATE1O95260 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATE1O95260 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATE1O95260 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATE1O95260 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATE1O95260 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATE1O95260 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATE1O95260 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms