Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
TOPBP1Q92547 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms