Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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