Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED27Q6P2C8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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