Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
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PTPRRQ15256 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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PTPRRQ15256 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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PTPRRQ15256 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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