Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BFSP2Q13515 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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